Cell | 染色质激活或抑制状态决定了核小体复合的差异性

2021-12-27 05:44:15 来源:
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线粒体结构设计通过促进或选择性该结构设计的转录可以遏制性状组的功能和细胞膜个人身份认定。这些线粒体结构设计里普遍存在特定的遗传物质翻译后修饰(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定转录稳定状态方面,并可促进选择性性染色体结构设计的形成,同样影响性状的表示。为了在增殖时依然保持良好介导程序在的持续性,立即线粒体结构设计的分子形态也需要在子代细胞膜里建立联系。建立联系不尽相同类改型线粒体稳定状态的重要立即因素是遗传物质PTMs,主要普遍存在于遗传物质H3和H4的尾巴上。因此,在增殖的过程里,除了DNA诱导,特异性核小体也需要重建,并均等到子代细胞膜里。确实,数据分析发现特异性的经典遗传物质(比如诱导仰赖的遗传物质)会在诱导圆锥后迅速重新组装。不尽相同的数据分析组发现H3K9me3和H3K27me2/3可通过体细胞膜突变。然而,这两个遗传物质修饰都是与选择性性线粒体结构设计方面。那么,特异性里的核小体,以及它们携带的遗传物质PTMs是否都能突变到子代细胞膜完全一致的性状观众席上呢?来自纽约大学兰戈恩医学里心的Danny Reinberg教授课题组在Cell刊载数据分析Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该数据分析发现在DNA诱导时,诱导与曾受选择性线粒体区域的核小体分离是不尽相同的。曾受选择性线粒体结构设计里的核小见识被就近在子代细胞膜完全一致的性状区域,而诱导改型线粒体结构设计里的核小体的均等则是弥散和随机的。为数据分析核小体的分离持续性,数据分析者在候选性状观众席不可逆的标识遗传物质H3.1和H3.2,以小鼠体细胞膜生殖细胞膜里核小体在增殖时的变异。简单来说,该方法通过邻近蛋白标识技术,利用CRISPR为特定性状观众席的H3.1和H3.2带上甘氨酸标识,经ChIP-qPCR侦测该甘氨酸标识在细胞膜周期G1期和S期的数量级,以里间体核小体的分离持续性。若该亚基H3.1和H3.2上的甘氨酸标识在一次增殖后下降一半,说明该核小体被就近在了两个子代细胞膜的完全一致性状观众席上;若该甘氨酸修饰刚刚绝迹,说明子代细胞膜并未突变该性状观众席的核小体。数据分析者首先侦测了在体细胞膜生殖细胞膜里沉默表示的Hoxc6, Ebf1, Meis2性状的核小体分离持续性。这些性状观众席的核小体甘氨酸高水平随增殖随之减半,这提示曾受选择性的性状观众席的核小见识被就近在子代细胞膜的完全一致位置。这与前人发现的H3K9me3和H3K27me2/3可通过体细胞膜突变的情况相印证。那么,诱导改型线粒体区域的核小体又是如何分离的呢?数据分析者侦测了在体细胞膜生殖细胞膜里被诱导表示的Ccna2, Nanog和Pou5f1性状,发现该性状观众席的甘氨酸标识在增殖后呈弥散稳定状态,数量级很低,这提示对于诱导改型线粒体区域来说,特异性核小体并未粗略的均等到子代细胞膜其所的性状观众席,而是随机均等的。更奇怪的是,在诱导体细胞膜生殖细胞膜分化时,Hoxc6性状由选择性转成诱导,它的核小体均等模式也由粗略的同亚基均等改回随机均等。这说明特异性核小体的局部均等,可以反映该线粒体区域的活性稳定状态。总的来说,该数据分析通过CRISPR正向的遗传物质甘氨酸标识系统,数据分析了核小体在增殖过程里的分式,并发现诱导与曾受选择性的线粒体区域的核小体分式的不尽相同。例外的是,在细胞膜周期的S期里,曾受选择性的线粒体区域的诱导要晚于诱导改型线粒体区域。这个时间差异也导致常线粒体的诱导速率大于异线粒体。异线粒体相对较慢的诱导速度可能尽可能了核小体的粗略均等,而常线粒体里的PTMs则由其所的主调节因子(master regulators)同样标识其所DNA序列,并招募PTMs核糖体重新建立联系。原始来历:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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