Cell | 染色质激活或诱导状态决定了核小体分离的差异性

线粒体形态通过推动或可抑制该形态的酪氨酸可以控制基因序列组的功能和巨噬细胞身份认定。这些线粒体形态之前存在特定的鸟嘌呤翻译后；也（posttranslational modifications，PTMs），它们与特定酪氨酸上述情况下方面，并可推动可抑制性线粒体形态的形成，影响基因序列的表述。为了在巨噬激活时依然应有基因序列表述应用程序的无损，立即线粒体形态的原子特性也只能在子代巨噬细胞之前建立。建立不同类型线粒体上述情况下的最重要立即因素是鸟嘌呤PTMs，合而为一要存在于鸟嘌呤H3和H4的尾巴上。因此，在巨噬激活的过程之前，除了DNA脱氧核糖核酸，表型核小体也只能重建，并平均分配到子代巨噬细胞之前。确实，研究成果辨认出表型的定格鸟嘌呤（比如脱氧核糖核酸依赖的鸟嘌呤）会在脱氧核糖核酸长柄后迅速再度组装。不同的研究成果组辨认出H3K9me3和H3K27me2/3可通过减数分裂基因型。然而，这两个鸟嘌呤；也都是与可抑制性线粒体形态方面。那么，表型之前的核小体，以及它们可携带的鸟嘌呤PTMs是否都能基因型到子代巨噬细胞相近的基因序列一层楼上呢？来自纽约大学兰戈恩医学之前心的Danny Reinberg教授课题组在Cell发表研究成果Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication，该研究成果辨认出在DNA脱氧核糖核酸时，介导与备受可抑制线粒体区域内的核小体裂解是不同的。备受可抑制线粒体形态之前的核小体悟被安置在子代巨噬细胞相近的基因序列区域内，而介导型线粒体形态之前的核小体的平均分配则是星体和随机的。为研究成果核小体的裂解上述情况，研究成果者在候选基因序列一层楼各种因素标示出鸟嘌呤H3.1和H3.2，以追踪小鼠体细胞干巨噬细胞之前核小体在巨噬激活时的变化。简单来说，该方法通过邻近受体标示出技术，借助CRISPR为特定基因序列一层楼的H3.1和H3.2带丙二酸标示出，经ChIP-qPCR检验该丙二酸标示出在巨噬细胞周期G1期和S期的丰度，以化学反应核小体的裂解上述情况。若该位点H3.1和H3.2上的丙二酸标示出在一次巨噬激活后下降一半，说明该核小体被安置在了两个子代巨噬细胞的相近基因序列一层楼上；若该丙二酸；也很快消失，说明子代巨噬细胞并未基因型该基因序列一层楼的核小体。研究成果者首先检验了在体细胞干巨噬细胞之前心碎表述的Hoxc6， Ebf1， Meis2基因序列的核小体裂解上述情况。这些基因序列一层楼的核小体丙二酸水平随巨噬激活随之减半，这提醒备受可抑制的基因序列一层楼的核小体悟被安置在子代巨噬细胞的相近方位。这与前人辨认出的H3K9me3和H3K27me2/3可通过减数分裂基因型的现象相说明了。那么，介导型线粒体区域内的核小体又是如何裂解的呢？研究成果者检验了在体细胞干巨噬细胞之前被介导表述的Ccna2， Nanog和Pou5f1基因序列，辨认出该基因序列一层楼的丙二酸标示出在巨噬激活后呈圆形星体上述情况下，丰度很低，这提醒对于介导型线粒体区域内来说，表型核小体并未直观的平均分配到子代巨噬细胞可视的基因序列一层楼，而是随机平均分配的。更有趣的是，在诱导体细胞干巨噬细胞分化时，Hoxc6基因序列由可抑制转为介导，它的核小体平均分配模式也由直观的同位点平均分配改为随机平均分配。这说明表型核小体的局部平均分配，可以反映该线粒体区域内的活性上述情况下。总的来说，该研究成果通过CRISPR引导的鸟嘌呤丙二酸标示出系统，研究成果了核小体在巨噬激活过程之前的平均分配方式，并辨认出介导与备受可抑制的线粒体区域内的核小体平均分配方式的不同。值得注意的是，在巨噬细胞周期的S期之前，备受可抑制的线粒体区域内的脱氧核糖核酸要晚于介导型线粒体区域内。这个等待时间关联也避免常线粒体的脱氧核糖核酸速率大于异线粒体。异线粒体相对快速的脱氧核糖核酸速度确实应有了核小体的直观平均分配，而常线粒体之前的PTMs则由可视的合而为一调节因子（master regulators）单独识别可视DNA序列，并招募PTMs酶再度建立。原始出处：Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.